هنگامی که شفر به استقلال آمد، ماه ها بود که فعالیت مربیگری نداشت و با آغوش باز و پیشنهاد مالی نه چندان سنگین، قرارداد باشگاه استقلال را پذیرفت.
ه گزارش تابناک ورزشی، برخی منابع در باشگاه استقلال با طرح ارقامی حدود 300هزاردلار افکار عمومی را در بدو ورود شفر فریب دادند تا انتقادها از چنین دستمزدی بالا نگیرد اما بعد از درخشش شفر آرام آرام مبلغ واقعی بدون هراس اولیه از اعتراض رسانه ها و مردم رو شد!
پیرمرد ژرمن خیلی زود دریافت که به تیم ضعیف و کوچکی نیامده! او در نخستین هفته های ورودش یعنی پس از بازی با فولاد خوزستان در نیم فصل اول به اطرافیانش گفت که استقلال بازیکنان خوبی دارد و تعجب میکند که چرا این تیم نتیجه نگرفته است.حضور بازیکنان خوبی چون سرور جپاروف، امید ابراهیمی، داریوش شجاعیان، روزبه چشمی و ... سرمربی استقلال را امیدوار کرد که برای موفقیت این تیم تلاش کند. استقلال به یکباره با مرد آلمانی متحول شد و نتایجی گرفت که دوباره تماشاگران استقلال را به ورزشگاه کشاند و مرد 67 ساله آلمانی با شال گردنی آبی خودش محبوب سکوها شد.
قرارداد شفر با استقلال یک سال و نیمه بسته شد که سال دوم آن توافقی است یعنی در صورت قهرمانی جام حذفی و کسب سهمیه آسیا قرارداد مرد آلمانی با توافق طرفین تمدید میشود. روی کاغذ قرارداد شفر 500هزار دلار به همراه 100 هزار دلار آپشن است. او دستیارانی از جمهوری چک و جامائیکا دارد و پسرش نیز به عنوان آنالیزور کار میکند. او به مدیران استقلال گفته که باید قرارداد دستیارانش تمدید و مبلغ قراردادشان بیشتر شود. همچنین در رابطه با مبلغ قرارداد او نیز صحبتهایی شده که شاید بیشتر از توافق اولیه باشد، اما طرفین آن را تکذیب کردند.
شفر با وجود اینکه پالس مثبتی از مدیران باشگاه ندید، اما خوب میداند که بهترین جا برای ادامه دوران مربیگریاش در حال حاضر استقلال است. تیمی که هر چند امکاناتی فوقالعادهای ندارد، اما تماشاگران زیادی دارد و او روی این موضوع و حمایت هواداران حساب باز کرده است. حضور در لیگ قهرمانان آسیا و صعود احتمالی به مرحله یک چهارم نهایی بیشتر از هر کسی به شفر این موقعیت را میدهد که در آسیا با استقلال به موفقیت برسد. از طرفی، بودن بازیکنانی که شفر به احترام آنها حتی در نشست خبری ایستاد، سرمربی استقلال را مجاب میکند که در این تیم بماند و به موفقیتهای آینده فکر کند.
فکر کردن به قهرمانی فصل آینده لیگ برتر، رسیدن به فینال آسیا و حتی حضور در جام باشگاههای جهان چیزی نیست که شفر بخواهد به راحتی از آن بگذرد. بنابراین، احتمال اینکه مرد آلمانی پس از بازیهای فصل قراردادش را تمدید کند، بیشتر از تردیدهای او برای رفتن به جای دیگر با پیشنهاد بهتر مالی است؛ البته اگر پیششرطهای اولیه (کسب سهمیه یا قهرمانی در جام حذفی) محقق شود.