متن پیام وی به این شرح است:

بسم الله الرحمن الرحیم

جنایت اخیر رژیم صهیونیستی در حمله به ساختمان کنسولگری جمهوری اسلامی ایران در دمشق که مغایر با کلیه مقررات بین‌المللی مبنی بر مصونیت اماکن دیپلماتیک است، برخاسته از خوی تجاوزگر و ماهیت تروریستی این رژیم است که ابایی از کشتار و جنایت ندارد.

این اقدام وحشیانه منجر به شهادت سرداران رشید، محمدرضا زاهدی و محمدهادی حاج‌رحیمی و دیگر مستشاران نظامی ایران و چند نفر از شهروندان سوریه شد که با تبریک و تسلیت آن به حضرت بقیه‌الله الاعظم(عج)، رهبر معظم انقلاب اسلامی، سپاه پاسداران انقلاب اسلامی و مردم شریف ایران، امیدوارم خداوند متعال بر علو درجات شهدای گرانقدر در این ماه مبارک بیافزاید.

سید حسن خمینی در پیامی جنایت اسرائیل در حمله به سفارت ایران را بی تردید محتاج پاسخی مناسب و بازدارنده دانست.

رژیم اسرائیل با این حمله درصدد هدف شوم گسترش دامنه جنگ در منطقه است که بی‌تردید با تدبیر مقام معظم رهبری خنثی خواهد شد و به فضل الهی، ثمره خون پاک این شهدای والامقام، تقویت اقتدار ایران و انعکاس حقانیت مقاومت و رسوایی هرچه بیشتر رژیم جنگ‌افروز و تروریستی اسرائیل خواهد شد.

حسن روحانی