در این میان، ابتدا، علی بهادری جهرمی، سخنگوی دولت وقت، به شبکه دو صداوسیما آمد و توضیحاتی را درباره جزئیات سقوط بالگرد حامل رئیسی و همراهانش داد. بنابر گفته بهادری جهرمی در تاریخ ۳ خرداد ماه، «محمد مخبر تیمی را فرستاد تا به همراه تیمی که در آنجا بودند، کار جستجو و تفحص را ادامه دهند. منصوری و وزیر بهداشت را هم به محل اعزام کردند؛ اما به من گفتند که به بقیه اعضای دولت اطلاع ندهیم و جلسه هیات دولت را برگزار کنیم. آقای رئیسی خیلی اصرار داشتند که در هر شرایطی نظم کاری حفظ شود.»
وی گفته بود: «در انتهای جلسه هیات دولت به همه اعضا اطلاع دادیم و جلسه بحران برگزار شد.خبر محرمانهای وجود نداشت و شرایط آب و هوایی موقع پرواز خیلی بد نبوده و مجوز پرواز داده بودند. باید بررسی شود که چرا هلیکوپتر بالا نرفته و داخل ابر یا مه رفته است.»
گزارش اولیه هیات عالی بررسی ابعاد و علل سانحه بالگرد حامل رئیس جمهور هم توسط ستاد کل نیروهای مسلح پنجشنبه در تاریخ ۲۳ خرداد ۱۴۰۳ منتشر شد. در این گزارش آمده بود: «بخش قابل توجهی از اطلاعات در زمینههای مختلف تخصصی، فنی و عمومی که میتوانست در وقوع سانحه دخیل باشد جمعآوری شده است.
برخی از اقدامات برای اظهار نظر قطعی نیاز به زمان بیشتری دارد که در دست بررسی بوده و برخی از موارد را میتوان با قاطعیت اعلام نمود که مورد اشاره قرار میگیرند:
۱_ بالگرد در مسیر پیش بینی شده از قبل ادامه مسیر داده و از مسیر تعیین شده پروازی خارج نگردیده است. حدود یک و نیم دقیقه قبل از سانحه بالگرد. ۲_ خلبان بالگرد سانحه دیده با دو بالگرد دیگر گروه پروازی ارتباط برقرار نموده است.۳_ آثار اصابت گلوله و یا موارد مشابه آن در اجزای باقی مانده بالگرد سانحه دیده مشاهده نگردیده است. ۴_ بالگرد سانحه دیده پس از برخورد با ارتفاع، دچار آتش سوزی شده است. ۵_ به دلیل پیچیدگی منطقه، مه گرفتگی و درجه حرارت پایین، عملیات تجسس به شب کشیده شده و در طول شب نیز استمرار می یابد و در بامداد صبح روز دوشنبه (ساعت ۵ صبح) با کمک پرنده های بدون سرنشین ( ایرانی) نقطه دقیق محل سانحه مشخص و نیروهای زمینی عملیات تجسس در آن نقطه حضور پیدا میکنند. ۶_ در مکالمات برج مراقبت با گروه پروازی نیز مورد مشکوکی مشاهده نگردیده است.»
اما علی رغم آنکه مقامات نظامی و حتی ستاد کل نیروهای مسلح آثار اصابت گلوله به بالگرد سقوط کرده را تکذیب کرده بودند، بازهم در فضای سیاسی و رسانهای شایعاتی درباره نحوه سقوط این بالگرد شنیده میشد.
در این میان، به فاصله ۳ روز بعد از مراسم تشییع پیکر شهید رئیسی و همراهانش، یعنی در تاریخ ۶ خرداد ماه، مستند «روایت سانحه» که حاوی تصاویری جدید از روز سانحه بالگرد رئیسجمهور و عملیات جستجوی برای یافتن این بالگرد است، در خبر ۱۴ شبکه یک سیما و شبکه خبر پخش شد. خبرنگار حاضر در صحنه و در این مستند خبری، با اشاره به دستور خلبان بالگرد رئیسجمهور برای عبور از ابرها، روایت کرده بود: «هنگام عبور بالگردها از ابر، ارتباط بالگرد حامل رئیسجمهور با دو بالگرد دیگر قطع میشود و تلاش برای برقراری تماس و پیدا کردن موقعیت و نشان بالگرد رئیسجمهور بینتیجه بود. تودهی ابر موجود دید را محدود کرده و جستجوی هوایی بینتیجه ماند. حدود ساعت ۱۴ دو بالگرد حوالی معدن مس سونگون تصمیم به فرود میگیرد تا بازدید زمینی داشته باشند. ساعت ۱۴.۱۸ یکی از تماسها با تلفن بالگرد حامل رئیسجمهور موفق بود و آیتالله آلهاشم تلفن همراهِ خلبان مصطفوی را پاسخ داد و آقای محرابیان وزیر نیرو در تماس تلفنی پرسید که بقیه کجا هستند و اطراف شما نیستند؟
برقراریِ این تماس امیدها را بر زنده بودن سرنشینان بیشتر کرد. البته؛ میشد با رهیابی تلفن همراه، موقعیت آنان را پیدا کرد ولی یک مشکل وجود داشت، اینکه یک آنتن بیتیاس در آن منطقه وجود داشت بود و با استفاده از یک آنتن نمیشد موقعیت دقیق را مشخص کرد اما منطقهای را بین روستاهای اوزی، اردشیر و طویل از توابع ورزقان مشخص شد.»
همچنین در این مستند تاکید شده بود: «خلبان بالگرد حامل رئیسجمهور ۱.۵ دقیقه قبل از سانحه با دو بالگرد دیگر ارتباط داشته و آثار اصابت گلوله در بالگرد مشاهده نشده و بالگردِ حامل رئیسجمهور بعد از برخورد با ارتفاع، دچار آتشسوزی شده است.»
دومین گزارش هیئت عالی بررسی ابعاد و علل سانحه بالگرد رئیس جمهور و هیئت همراه در ۹ خرداد ماه منتشر شد. در بخشهایی از این گزارش آمده بود: «با توجه به نمونه برداری و آزمایشات صورت گرفته از بقایا و قطعات بالگرد و نحوه پراکندگی آنها و فواصل اجزاء جدا شده از بدنه اصلی، وقوع انفجار ناشی از خرابکاری در جریان پرواز و لحظات قبل از برخورد به دامنه ارتفاعات منتفی میباشد.»
همچنین در ستاد کل نیروهای مسلح تاکید کرده بود: «در طول مدت ماموریت و تا ۶۹ ثانیه قبل از وقوع سانحه، تماس روی فرکانسهای مشخص شده با بالگرد سانحه دیده برقرار بوده و آخرین تماس و پیام نیز توسط فرمانده گروه پروازی (شهید مصطفوی) صورت گرفته است لذا هرگونه بروز اختلال در سامانه ارتباطی و یا تداخل فرکانسی منتفی میباشد. ( لازم به ذکر است ارتباط بین دو فروند بالگرد دیگر کماکان تا فرود در معدن مس سون گون ادامه داشته است). برابر گزارش کارشناسان تخصصی آثاری ناشی از اقدامات جنگ الکترونیک بر روی بالگرد سانحه دیده مشاهده نشده است.»