سرانجام پس از کش و قوس های فراوان و یک روز پس از آنکه واعظی گفت دولت به راحتی قاضی زاده هاشمی را از دست نمی دهد، حسن روحانی با "قدردانی از خدمات خالصانه و تلاش های صادقانه دکتر سید حسن قاضی زاده هاشمی وزیر بهداشت، درمان و آموزش پزشکی طی دولت های یازدهم و دوازدهم، به ویژه در اجرا و پیشبرد طرح تحول سلامت" استعفای وی را پذیرفت و دکتر «سعید نمکی» را به عنوان سرپرست وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی منصوب کرد.

سرانجام پس از کش و قوس های فراوان و یک روز پس از آنکه واعظی گفت دولت به راحتی قاضی زاده هاشمی را از دست نمی دهد، حسن روحانی با "قدردانی از خدمات خالصانه و تلاش های صادقانه دکتر سید حسن قاضی زاده هاشمی وزیر بهداشت، درمان و آموزش پزشکی طی دولت های یازدهم و دوازدهم، به ویژه در اجرا و پیشبرد طرح تحول سلامت" استعفای وی را پذیرفت و دکتر «سعید نمکی» را به عنوان سرپرست وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی منصوب کرد.
 
به گزارش مردم سالاری آنلاین، قاضی زاده هاشمی به خاطر اختلافات با نوبخت، رییس سازمان برنامه و بودجه بر سر بودجه طرح تحول سلامت از وزارت بهداشت استعفا داد و حال، فردی که معاون سازمان برنامه و بودجه است، به عنوان جانشین او انتخاب شد تا قدرت نوبخت در دولت افزایش یابد.
 
سعید نمکی دارای دکترای ایمونولوژی و عضو هیئت علمی دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، معاون سازمان برنامه و بودجه کشور، عضو شورای سیاستگذاری مرکز ملی تحقیقات بیمه سلامت و معاونت سابق سازمان محیط‌زیست در زمان ریاست معصومه ابتکار است. او در سال ۱۳۹۴ به معاونت امور اجتماعی و عمومی در سازمان مدیریت (سازمان برنامه و بودجه) منصوب شد و تفاهم نامه نقشه درمان ایران ۱۴۰۴ میان وزارت بهداشت و سازمان برنامه و بودجه توسط او از جانب سازمان برنامه و بودجه امضا شد. بر اساس این تفاهم‌نامه در راستای افزایش عدالت جغرافیای مقرر شد که تفاوت میان استان‌ها و تفاوت درون استان‌ها، با توزیع تخت‌های جدید، به میزان حداقل ۲۵ درصد کاهش یابد. او منتقد طرح تحول سلامت هم بود و گفته بود متأسفانه طرح تحول سلامت، درمان‌محور و پزشک محور به جای پیشگیری‌محور و بیمارمحور بوده ‌است.